超聲波細(xì)胞粉碎機(jī)在基因測序中的應(yīng)用
一、超聲波細(xì)胞粉碎機(jī)在基因測序中的應(yīng)用
隨著技術(shù)的發(fā)展,遺傳信息及其表達(dá)調(diào)控的研究手段越來越多,高通量測序技術(shù)是其中最有效的手段之一。目前,利用高通量測序手段研究生物遺傳信息和基因表達(dá)調(diào)控信息已相當(dāng)普及。然而,測序前需要先制備適當(dāng)大小DNA片段的樣本文庫。因此,測序前需要對基因組DNA進(jìn)行破碎,使其片段長度滿足測序要求。RNA-seq對測序片段的長度要求也和DNA高通量測序的一樣。目前三大主流測序平臺的平均測序讀長基本在100~400bp范圍內(nèi)。其中Illumina測序平臺更是主流中的主流,其測序片段的讀長是150bp×2,其雙端測序需要的樣本DNA片段長度為300bp左右。片段太長或太短,都不能經(jīng)濟(jì)有效地實(shí)現(xiàn)高通量測序過程。如片段太長,會在固定DNA到固體基質(zhì)上時的效率低下且影響后續(xù)的測序效果、降低測序量。如果片段太短,則會導(dǎo)致測序讀長偏短、增加測序成本和后續(xù)拼接的工作量。因此,測序前首先要獲得高質(zhì)量的核酸片段。
二、超聲波細(xì)胞粉碎機(jī)的使用
超聲波細(xì)胞粉碎機(jī)進(jìn)行破碎前，需將樣品溶解在溶液中，然后通過探頭對樣品進(jìn)行超聲破碎
三、超聲波細(xì)胞粉碎機(jī)的應(yīng)用
儀器被廣泛應(yīng)用于生物學(xué)、微生物學(xué)、物理學(xué)、動物學(xué)、農(nóng)學(xué)、制藥、石油等領(lǐng)域的教學(xué)、科研、生產(chǎn)。適合單個樣品量少，樣本數(shù)多實(shí)驗的好幫手，例如細(xì)胞破碎，裂解；抽提蛋白、核酸；修剪DNA/RNA；.納米技術(shù)研究，納米材料的分散；.染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)；樣品均質(zhì)、乳化；加速溶解，加速化學(xué)反應(yīng)等其它樣品處理。
